Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc4Q3UP24 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nlrc4Q3UP24 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms