Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Skap2Q3UND0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skap2Q3UND0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms