Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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