Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrch2Q3UMG5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms