Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Cops9Q3U898 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Cops9Q3U898 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Cops9Q3U898 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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