Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hvcn1Q3U2S8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms