Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms