Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc174Q3U155 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms