Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ankrd33bQ3U0L2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms