Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms