Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TchpQ3TVW5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms