Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms