Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms