Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms