Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRG0

Gm1604b, Gene model 1604B, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1604bQ3TRG0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm1604bQ3TRG0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm1604bQ3TRG0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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