Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3TQQ9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TQQ9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms