Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms