Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uri1Q3TLD5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms