Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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