Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam107bQ3TGF2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Fam107bQ3TGF2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Fam107bQ3TGF2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Fam107bQ3TGF2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Fam107bQ3TGF2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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