Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hddc2Q3SXD3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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