Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl1Q2VPR5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms