Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Specc1lQ2KN98 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms