Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fgfbp3Q1HCM0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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