Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms