Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptcd3Q14C51 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms