Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd9Q14BI7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Tdrd9Q14BI7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Tdrd9Q14BI7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms