Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd12Q0VE29 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd12Q0VE29 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms