Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms