Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms