Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms