Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou6f1Q07916 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou6f1Q07916 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms