Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms