Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn3Q07409 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms