Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms