Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox9Q04887 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms