Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms