Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn6Q03958 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms