Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms