Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Mmp11Q02853 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Mmp11Q02853 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mmp11Q02853 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mmp11Q02853 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mmp11Q02853 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp11Q02853 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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