Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1sQ02789 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacna1sQ02789 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms