Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms