Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms