Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms