Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms