Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms