Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2aQ01320 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms