Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms