Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde1bQ01065 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms