Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms